#NEXUS

[File saved Tue Nov 23 16:08:09 2004]

BEGIN TAXA;
	TITLE DUP; [internal gene family name 10_2/G]
	DIMENSIONS NTAX = 10;
	TAXLABELS
		YGL263W
		YNR075W
		YKL219W
		YHL048W
		YGR295C
		YML132W
		YFL062W
		YNL336W
		YDL248W
		YJR161C
		;
ENDBLOCK;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE  DTT2;
	DIMENSIONS NCHAR=4;
	FORMAT DATATYPE = CONTINUOUS;
	MATRIX
	YGL263W -0.71 0.53 1.36 -0.29 
YNR075W -0.24 0.11 0.82 0.39 
YKL219W -0.32 0.23 0.81 0.65 
YHL048W -0.49 0.06 0.97 1.14 
YML132W -0.47 0.29 1.05 1.13 
YGR295C -0.17 -0.01 0.76 0.92 
YDL248W 0.08 0.12 0.19 0.16 
YFL062W -0.09 -0.14 0.69 1.05 
YJR161C -0.23 0.31 0.65 0.6 
YNL336W -0.25 0.25 0.01 0.9
;

END;
BEGIN CHARACTERS;
	TITLE  Cell_Cycle_Alpha
	DIMENSIONS NCHAR=17;
	FORMAT DATATYPE = CONTINUOUS;
	MATRIX
	YGL263W -0.48 0.02 0.69 -0.27 0.56 -0.23 -0.24 -0.32 0.21 -0.19 0.97 -0.76 0.3 0.03 -0.53 0.3 -0.46 0.4
YNR075W 0.54 -0.61 0.53 -0.25 -0.24 -0.07 -0.13 0.09 0.55 -0.82 0.2 0.33 0.16 -0.49 0.02 -0.06 0.08 0.17
YKL219W -0.08 -0.17 0.71 -0.41 0.49 -0.24 0.04 -0.49 0.06 -0.13 0.43 -0.64 0.4 0.25 -0.42 0.34 -0.68 0.54
YHL048W -0.24 0.16 0.79 -0.54 0.28 -0.42 -0.04 -0.24 0.21 -0.34 0.6 -0.04 0.02 -0.05 -0.37 0.12 -0.73 0.83
YML132W 0.05 -0.17 0.35 0.01 0.2 -0.5 0.27 -0.63 0.34 -0.32 0.61 -0.25 0.38 -0.1 -0.27 -0.26 0.02 0.27
YGR295C 0.01 -0.18 0.64 -0.28 0.35 -0.74 0.44 -0.77 0.36 -0.13 0.27 0 0.45 -0.29 -0.31 0.28 -0.39 0.29
YDL248W -0.2 0.23 0.13 0.05 -0.05 -0.22 -0.33 0.11 0.3 -0.15 0.44 -0.36 0.3 -0.21 0.17 -0.33 -0.02 0.14
YFL062W -0.34 0.45 0.12 0.14 -0.19 -0.11 -0.3 0.06 0.02 0.23 0.1 -0.06 0.02 -0.07 -0.09 -0.24 0.04 0.22
YJR161C -0.13 0.06 0.46 -0.07 0.01 -0.46 0.07 -0.21 0.24 -0.34 0.64 -0.29 0.2 0.17 -0.22 -0.46 -0.24 0.57
YNL336W -0.06 -0.08 0.64 -0.13 0.16 -0.71 0.22 -0.17 0 -0.14 0.31 -0.08 0.18 0.15 -0.51 0.2 -0.49 0.51
;

END;
BEGIN CHARACTERS;
	TITLE  Sorbitol;
	DIMENSIONS NCHAR=7;
	FORMAT DATATYPE = CONTINUOUS;
	MATRIX
	YGL263W 0.04 0.21 -0.24 0.22 0.18 0.04 -0.09 
YNR075W -0.56 -0.04 -0.32 0.74 0.06 0.11 -0.13 
YKL219W -0.22 0.41 0.21 -0.28 -0.11 -0.04 0.31 
YHL048W 0.29 0.03 0.24 -0.07 -0.33 0.02 0.4 
YML132W 0.15 0.26 0.16 -0.06 -0.27 -0.39 0.73 
YGR295C 0.24 0.13 -0.14 0.18 -0.31 -0.07 0.38 
YDL248W 0.04 0.13 -0.15 0.21 -0.35 0.2 0.01 
YFL062W 0.18 0.3 -0.16 0.11 -0.4 0.09 0.41 
YJR161C 0.1 0.27 0.17 -0.04 -0.29 0.03 0.32 
YNL336W -0.04 0.65 -0.12 0.14 -0.51 0.18 -0.09 
;

END;
BEGIN CHARACTERS;
	TITLE  Diamide;
	DIMENSIONS NCHAR=8;
	FORMAT DATATYPE = CONTINUOUS;
	MATRIX
	YGL263W -0.4 -0.11 -0.18 0.02 -0.48 0.39 -0.1 0.02
YNR075W -0.18 -0.82 0 0.29 -0.03 0.31 0.98 -0.26
YKL219W -0.1 0.31 -0.05 0.21 0.05 -0.01 -0.15 0.02
YHL048W 0.04 0.29 0.06 -0.01 -0.02 -0.02 0.21 -0.18
YML132W 0.1 0.4 -0.07 -0.22 0.31 -0.2 0.18 -0.21
YGR295C 0.31 0.27 -0.08 -0.07 -0.02 0 0.17 -0.3
YDL248W 0.36 0.02 -0.04 -0.17 -0.08 -0.16 0.43 -0.52
YFL062W 0.28 0.3 0 -0.05 -0.13 -0.11 0.05 -0.26
YJR161C 0.04 0.45 0.01 0.04 -0.03 -0.02 0.13 -0.17
YNL336W 0.07 0.21 -0.09 0.05 0.02 0 0.17 -0.13
;

END;
BEGIN CHARACTERS;
	TITLE  Diauxic_Shift;
	DIMENSIONS NCHAR=7;
	FORMAT DATATYPE = CONTINUOUS;
	MATRIX
	YGL263W -0.6 0.33 0.53 -0.38 -0.05 0.68 -0.35 
YNR075W 0.04 0.12 -0.19 -0.44 -0.2 -0.42 -0.31 
YKL219W 0.04 0.34 0.49 -0.49 0.15 -0.22 -0.21 
YHL048W 0.3 0.32 0.3 -0.28 0.05 0.25 -0.26 
YML132W 0.14 0.24 0.2 -0.22 0.26 0.18 -0.11 
YGR295C 0.04 0.04 0.29 0.15 0.13 0.01 -0.89 
YDL248W 0.19 0.35 -0.09 0 -0.06 0.47 -0.43
YFL062W 0.16 0.17 0.42 -0.09 -0.02 0.22 -0.8
YJR161C 0.48 -0.14 0.31 0 0.01 0.43 -0.39
YNL336W 0.12 0.16 0.26 -0.23 0.39 0.23 -0.43
;

END;
BEGIN CHARACTERS;
	TITLE  Heat2;
	DIMENSIONS NCHAR=7;
	FORMAT DATATYPE = CONTINUOUS;
	MATRIX
	YGL263W 0.42 0.16 -0.67 0.02 -0.18 -0.29 0.12 
YNR075W -0.1 -0.22 0.32 0.06 -0.24 0.01 0.33 
YKL219W 0.08 -0.3 -0.07 -0.01 0.29 0.52 -0.36 
YHL048W -0.43 -0.11 0 0.32 0.6 0.19 -0.21 
YML132W -0.17 -0.13 0.07 0.05 0.59 -0.01 -0.44 
YGR295C -0.42 0.22 0.1 0.22 0.38 -0.08 -0.24 
YDL248W -0.37 0.06 0 0.22 0.67 -0.27 -0.16 
YFL062W -0.18 -0.05 0.14 0.1 0.81 -0.18 -0.48 
YJR161C -0.36 0.04 -0.08 0.06 0.79 -0.22 0.03 
YNL336W -0.32 0.07 -0.09 0.12 0.54 0.21 -0.56 
;

END;
BEGIN CHARACTERS;
	TITLE  Menadione;
	DIMENSIONS NCHAR=9;
	FORMAT DATATYPE = CONTINUOUS;
	MATRIX
	YGL263W 0.07 -0.29 0.15 -0.1 0.05 -0.06 0.36 -0.48 0.4
YNR075W -0.2 -0.64 0.39 -0.29 0.23 0.62 0.12 0.11 -0.3
YKL219W 0.29 0.09 0.03 0.08 0.05 -0.06 -0.04 0.18 0.4 
YHL048W 0.59 0.03 0.15 -0.01 0.01 -0.03 0.16 0.18 0.45 
YML132W 0.5 0.17 0.08 -0.1 0.09 -0.16 0.26 0.28 0.21 
YGR295C 0.2 0.06 0.25 0.08 -0.27 0.22 0.32 -0.02 0.3 
YDL248W -0.04 -0.36 0.94 0 0.09 -0.02 0.33 0.04 0.08 
YFL062W 0.29 0.27 0.1 -0.14 0.07 0.22 -0.17 0.31 0.17 
YJR161C 0.7 0.05 0.13 -0.1 0.16 0.09 0.08 0.26 0.13 
YNL336W 0.39 0.09 0.13 -0.02 -0.05 0.05 0.23 -0.28 0.75 ;

END;
BEGIN CHARACTERS;
	TITLE  Nitrogen_Deletion;
	DIMENSIONS NCHAR=10;
	FORMAT DATATYPE = CONTINUOUS;
	MATRIX
	YGL263W -0.54 -0.04 -0.02 -0.14 0.36 -0.18 0.22 -0.4 -0.66 0.28
YNR075W -0.27 0.31 -0.68 0.1 0.34 -0.56 -0.24 -0.32 0.03 -0.45
YKL219W -0.2 0.02 -0.09 0.07 0.19 0.08 -0.43 0.04 -0.6 0.21
YHL048W 0.08 -0.17 -0.05 0.07 1.12 -0.11 -0.4 -0.06 -0.2 0.17
YML132W 0.33 -0.34 -0.19 -0.18 1.57 -0.12 -0.73 0.06 -0.08 -0.12
YGR295C 0.39 -0.43 -0.11 -0.15 1.39 -0.49 0.04 -0.03 -0.04 -0.2
YDL248W 0.11 -0.39 0.07 -0.21 1.09 -0.45 -0.14 -0.2 -0.15 0.4
YFL062W 0.39 -0.61 0.08 0.07 1.12 -0.25 -0.05 -0.25 -0.02 -0.17
YJR161C 0.01 -0.01 -0.23 0.01 1.29 -0.08 -0.42 -0.31 0.13 -0.13
YNL336W 0.16 -0.36 -0.29 0.22 1.44 -0.42 -0.23 -0.22 -0.05 0.14
;

END;
BEGIN CHARACTERS;
	TITLE  Zinc;
	DIMENSIONS NCHAR=9;
	FORMAT DATATYPE = CONTINUOUS;
	MATRIX
	YGL263W -1.29 -0.65 0.51 0.25 0.54 -1.76 1 -1.24 0.95 
YNR075W 1.05 0.32 -2.08 1.91 0.6 -0.23 -0.51 0.71 -1.21 
YKL219W 0.16 0.14 -0.36 -0.34 1.3 -0.87 0.4 0.21 0.06 
YHL048W 0.28 0.28 -1.23 -0.12 1.97 -1.35 0.43 1 -0.32 
YML132W 0.38 0.25 -1.69 0.22 2.04 -1.26 0.27 1.12 -0.4 
YGR295C 0.74 0.12 -1.86 0.73 1.83 -1.52 0.47 0.69 -0.14 
YDL248W 0.33 -0.02 -0.75 0.02 1.24 -1.63 1.06 0.51 -0.5 
YFL062W 0.54 0.32 -1.83 0.54 1.8 -1.4 0.46 0.69 -0.31 
YJR161C 0.46 0.2 -1.3 0 1.76 -1.11 0.28 0.59 -0.04 
YNL336W 0.36 0.39 -1.26 -0.05 2.01 -1.74 0.57 0.84 -0.22 ;

END;
BEGIN CHARACTERS;
	TITLE  Cell_Cycle_elu;
	DIMENSIONS NCHAR=14;
	FORMAT DATATYPE = CONTINUOUS;
	MATRIX
	YGL263W 0.35 -0.61 0.39 -0.21 0.38 -0.43 0.16 -0.02 0.14 -0.21 -0.02 -0.32 0.34 0.17 
YNR075W 0.04 0.09 0.18 -0.23 -0.09 0.14 0.14 -0.23 -0.53 0.32 0.16 0.05 -0.42 0.39 
YKL219W 0.36 -0.08 -0.21 -0.28 0.25 -0.32 0.46 -0.2 0.09 -0.3 -0.07 0.26 0.24 -0.32 
YHL048W 0.71 -0.54 -0.14 -0.06 0.1 -0.35 0.42 -0.21 -0.19 -0.15 0.47 -0.17 0.1 -0.02 
YML132W 0.31 -0.36 -0.07 0.07 -0.21 0.09 0.22 -0.24 0.36 -0.43 0.36 0.03 0.17 -0.25 
YGR295C 0.01 0.05 -0.36 0.15 -0.25 0.28 -0.26 0.47 0.11 -0.3 0.06 0.34 0.17 -0.1 
YDL248W 0.12 0.31 -0.33 -0.18 -0.23 0.24 0.02 0.21 -0.37 -0.08 0.14 0.06 0.33 -0.04 
YFL062W 0.3 0.12 0.03 -0.73 -0.09 0.28 0.16 0.05 -0.32 -0.2 0.43 -0.17 0.3 -0.22 
YJR161C 0.51 -0.67 0.17 -0.02 -0.15 0.2 0.18 -0.32 0.03 -0.29 0.22 0.25 -0.01 -0.11 
YNL336W 0.92 -0.76 -0.08 -0.03 -0.09 -0.21 0.42 -0.33 -0.02 -0.4 0.54 -0.03 0.11 -0.15 ;

END;
BEGIN CHARACTERS;
	TITLE  Cell_Cycle_CDC28;
	DIMENSIONS NCHAR=14;
	FORMAT DATATYPE = CONTINUOUS;
	MATRIX
	YGL263W -0.54 0.34 0.4 -0.16 -0.51 0.33 0.05 0.26 -0.01 -0.36 0.63 -0.32 0.14 -0.09 -0.16 
YNR075W 0.31 0.14 0.28 0 -0.76 -0.52 0.58 -0.41 0.15 0.26 -0.58 0.46 -0.37 0.43 0.06 
YKL219W 0.19 0.27 -0.54 -0.2 0.03 -0.46 0.19 0.66 0.54 -0.59 -0.82 1.19 0.1 -1.27 0.49 
YHL048W 0.4 -0.72 0.17 0.09 0.11 0.03 0.02 -0.13 -0.52 0.94 -0.43 0.08 0.09 -0.25 0.12 
YML132W 0.08 -0.24 0.27 -0.47 -0.07 0.06 0.5 -0.52 0.41 0.14 -0.06 0.28 -0.1 -0.34 0.06 
YGR295C -0.06 -0.15 0.49 0.04 -0.17 0.18 0.06 -0.18 -0.46 0.12 -0.19 0.14 0.13 -0.09 0.14 
YDL248W 0.19 -0.74 0.84 0.09 -1.02 0.88 0.33 -0.3 -0.03 -0.45 0.3 0.46 -0.17 -0.63 -0.58
YFL062W -0.27 0.22 0.19 -0.12 -0.02 -0.32 0.36 -0.22 0.07 -0.02 0.24 0.2 -0.32 0.11 -0.1
YJR161C -0.02 -0.4 0.33 0.04 0.18 -0.37 0.21 -0.05 0.14 -0.04 -0.07 0.48 -0.05 -0.73 0.35
YNL336W -0.16 -0.02 0.05 -0.01 0.22 -0.61 0.39 -0.18 0.21 0.49 0.05 -0.29 0.04 0.06 -0.15;

END;
BEGIN CHARACTERS;
	TITLE  H2O2;
	DIMENSIONS NCHAR=8;
	FORMAT DATATYPE = CONTINUOUS;
	MATRIX
	YGL263W -0.34 0.35 -0.33 0.29 0.27 -0.3 0.31 0.43 
YNR075W -0.4 0.72 -0.22 -0.5 0.28 -0.11 0.13 -0.1 
YKL219W 0.11 0.33 -0.06 -0.35 0.26 -0.38 0.28 0.15 
YHL048W 0.38 0.82 -0.32 -0.11 -0.24 -0.39 0.41 0.02 
YML132W 0.3 0.23 0.27 -0.4 0.14 -0.33 0.45 -0.02 
YGR295C -0.09 1.06 -0.24 -0.48 -0.11 -0.23 0.5 -0.01 
YDL248W 0.71 0.06 -0.34 0 -0.07 -0.31 0.54 -0.16 
YFL062W 0.1 0.6 0.05 -0.61 0.35 0.1 -0.02 0.12 
YJR161C 0.67 0.31 0.06 -0.36 -0.43 0.06 0.05 -0.17 
YNL336W -0.07 0.6 -0.01 -0.19 -0.01 -0.42 0.39 -0.11 ;

END;
BEGIN CHARACTERS;
	TITLE  Cell_Cycle_CDC15;
	DIMENSIONS NCHAR=5;
	FORMAT DATATYPE = CONTINUOUS;
	MATRIX
	YGL263W 0.04 -0.11 0.04 -0.45 0.17
YNR075W -0.08 -0.06 0.11 -0.23 -0.11
YKL219W -0.15 0.33 -0.71 0.06 0.09
YHL048W 0.05 0 -0.09 0.04 0.06
YML132W -0.02 0.05 -0.15 -0.01 0.1
YGR295C 0.16 -0.02 -0.06 0 0.18
YDL248W -0.41 0.74 -1.29 0.42 0.12
YFL062W -0.21 0.35 -0.65 -0.15 0.28
YJR161C -0.03 0.13 -0.27 -0.04 0.04
YNL336W 0.49 -0.63 0.29 0.48 -0.28
;

END;

BEGIN TREES;
	TRANSLATE
		1	YGL263W,
		2	YNR075W,
		3	YKL219W,
		4	YHL048W,
		5	YGR295C,
		6	YML132W,
		7	YFL062W,
		8	YNL336W,
		9	YDL248W,
		10	YJR161C
		;
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