#NEXUS [File saved Tue Nov 23 16:07:34 2004] BEGIN TAXA; TITLE Permeases; [internal gene family name 17_1/I] DIMENSIONS NTAX = 17; TAXLABELS YBR068C YDR046C YCL025C YDR508C YBR069C YGR191W YKR039W YPL274W YLL061W YOL020W YOR348C YPL265W YNL270C YEL063C YNL268W YFL055W YBR132C ; ENDBLOCK; BEGIN CHARACTERS; TITLE Cell_Cycle_elu; DIMENSIONS NCHAR=14; FORMAT DATATYPE = CONTINUOUS; MATRIX ybr068c -0.16 0.17 -0.62 0.73 -0.38 0.17 0 0.06 0.19 0.27 -0.46 0.32 -0.3 0.3 yor348c -1.86 1.73 0.24 -0.08 -0.36 -0.03 0.45 0.51 0.03 -0.4 -0.25 0.26 0.19 -0.07 ycl025c 0.38 -0.41 -0.37 0.26 -0.02 0.07 0.14 0.08 0.08 -0.13 -0.35 0.57 -0.21 -0.23 ynl270c -0.77 0.91 -0.51 0.23 -0.23 -0.04 0.47 0.19 0.2 -0.35 -0.1 0.33 0.19 -0.32 ygr191w -0.75 0.44 -0.21 0.25 0.56 -0.14 -0.22 0.47 -0.21 0.39 -0.68 0.29 -0.18 0.2 yfl055w -0.22 0.57 -0.25 -0.55 -0.05 0.14 0.2 0.21 0.23 -0.09 -0.24 0.32 0.1 -0.24 yel063c -0.44 0.71 -0.51 0.01 0.48 -0.24 0.02 -0.07 0.07 -0.15 -0.14 0.51 -0.12 0.24 yol020w -0.54 0.44 -0.09 0.09 0.33 -0.02 0.16 -0.19 -0.1 -0.03 -0.36 0.45 -0.07 -0.17 ypl274w -0.75 0.5 -0.21 0.58 -0.33 0.25 0.03 0.14 0.08 0.4 -0.87 0.3 0.16 -0.26 ydr046c -0.86 0.57 0.02 -0.08 0.03 0.43 0 0.52 -0.34 0.28 -0.58 0.19 -0.06 -0.03 ynl268w 0.12 -0.12 -0.18 -0.09 0.38 0.08 0.04 -0.18 0.04 -0.15 0.02 0.03 -0.05 -0.12 ykr039w -1.53 1.45 -0.09 0.21 -0.7 0.11 0.32 0.93 0.06 -0.46 -0.71 0.8 0.44 -0.22 ypl265w -0.11 -0.78 0.73 0.03 -0.15 1.03 -0.79 0.12 0.12 -0.24 0 0.33 -0.09 -0.06 yll061w -0.87 1.39 -0.51 -0.02 -0.08 0.05 0 0.08 0.22 0.37 -0.72 0.3 -0.55 0.16 ybr069c -1.62 1.64 -0.26 0.19 0.12 -0.02 0.09 0.05 0.34 -0.55 -0.13 0.59 0.06 -0.36 ydr508c -1.47 1.57 -0.36 0.35 0.07 0.16 -0.23 0.23 -0.25 0.16 -0.21 -0.15 0.31 0.1 ybr132c 0.19 -0.48 -0.06 0.08 -0.32 0.1 0.52 0.07 0.51 -0.29 -0.53 0.85 -0.77 0.56 ; 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END; BEGIN CHARACTERS; TITLE Sorbitol; DIMENSIONS NCHAR=7; FORMAT DATATYPE = CONTINUOUS; MATRIX ybr068c 0.26 0.33 -0.24 -0.16 -0.26 0.25 -0.14 yor348c 0 0.53 -0.43 -0.09 -0.1 0.17 -0.17 ycl025c 0.1 0.15 -0.75 0.19 0.32 0.32 -0.59 ynl270c -0.25 0.37 -0.02 0.13 0.25 -0.28 -0.4 ygr191w -0.3 -0.17 0.46 0.5 -0.5 0.19 -0.15 yfl055w 0.15 -0.11 0.15 -0.23 0.47 0.02 -0.33 yel063c 0.1 -0.27 0.71 -0.33 -0.21 -0.06 -0.09 yol020w 0.12 -0.34 0.07 0.18 -0.07 -0.05 -0.31 ypl274w -2.06 1.64 -0.09 0.52 0.27 -0.51 0 ydr046c 0.24 -0.16 -0.05 -0.23 0.2 0 -0.56 ynl268w -0.43 -0.54 0.82 0.21 0.22 -0.37 -0.08 ykr039w 0.07 0.38 -0.68 0 0.24 -0.08 0.08 ypl265w -0.32 1.18 -0.57 -0.98 -0.82 1.5 0.3 yll061w 0.18 -0.3 -0.06 -0.63 1.18 0.25 -0.61 ybr069c -0.26 -0.27 0.02 0.15 0.32 0.28 -0.19 ydr508c 0.67 0.26 -1 -0.36 0.39 0.28 -0.18 ybr132c 0.07 1.14 -0.58 -0.42 -0.42 0.67 -0.43; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE Heat2; DIMENSIONS NCHAR=6; FORMAT DATATYPE = CONTINUOUS; MATRIX ybr068c -0.42 0.24 0.63 -0.31 0.1 -0.82 yor348c -0.03 -1.06 2.24 -0.21 -0.24 -1.38 ycl025c -0.64 0.12 1.62 -1.57 0.13 -0.3 ynl270c 0.57 -0.89 0.46 -0.21 0.35 -0.34 ygr191w 0.56 0.3 -1.16 -0.51 0.77 0.4 yfl055w 0.21 -1.21 0.44 0.72 0.3 -0.31 yel063c 0.04 -0.04 -0.69 0.49 0.26 0.05 yol020w 0.22 0.08 -0.52 0.55 -0.25 0.32 ypl274w 0.18 0.24 -0.19 -0.78 1.21 -0.47 ydr046c -0.2 0.7 -0.86 0.04 0.55 2.58 ynl268w 0.24 -0.42 -0.51 0.22 0.53 0.13 ykr039w -1.03 0.34 1.26 -0.33 0.44 -1.24 ypl265w -1.17 -0.12 1.08 0.7 0.52 -1.59 yll061w 0.24 0.24 -0.58 -0.74 0.84 0.26 ybr069c 0.73 0.05 -0.82 -1.14 0.44 1.1 ydr508c -0.47 0.22 0.13 0.22 0.59 -0.4 ybr132c -1.84 -0.29 1.9 1.6 -0.67 -1.51 ; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE Menadione; DIMENSIONS NCHAR=5; FORMAT DATATYPE = CONTINUOUS; MATRIX ybr068c 0.59 -0.13 -0.46 0 0 0.24 yor348c -0.3 -0.15 -0.26 0.37 0.25 0.09 ycl025c 0.24 0.07 0.05 -0.24 0.04 -0.16 ynl270c -0.04 -0.93 0.59 0.08 1.05 -0.87 ygr191w -0.32 0.28 -0.13 0.1 -0.13 0.05 yfl055w 0.06 -1.28 0.92 0.49 -1 0.97 yel063c -0.14 0.25 -0.2 0.06 -0.29 0.07 yol020w -1.09 0.87 -0.16 0.09 -0.22 -0.11 ypl274w -0.23 -0.24 0.47 -0.51 -0.03 -0.06 ydr046c -0.34 0.27 0.14 -0.06 0.23 -0.27 ynl268w -0.18 -0.07 0.21 0.24 -0.01 -0.03 ykr039w -1.25 -0.04 0.97 0.17 0.83 -0.98 ypl265w -0.17 0.17 0 0.28 -0.07 0.37 yll061w 0.45 -0.37 -0.42 0.02 0.33 -0.04 ybr069c -0.04 -0.38 0.28 0.15 0.03 -0.11 ydr508c -0.97 -0.18 0.29 0.17 -0.12 0.21 ybr132c -0.1 0.29 -0.16 -0.03 -0.71 0.48 ; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE Zinc; DIMENSIONS NCHAR=8; FORMAT DATATYPE = CONTINUOUS; MATRIX ybr068c 0.37 -0.1 2.37 -2.45 2.08 -1.28 -1.03 -1.7 yor348c -0.74 0.12 -1.63 1.51 -0.73 0.66 0.52 1.4 ycl025c -0.2 0.16 0.49 -0.03 0.94 0.15 0.02 -0.47 ynl270c -0.86 0.52 -0.69 0.61 -1.27 0.63 0.17 0.44 ygr191w 0.54 -0.28 -0.05 -0.14 1.25 -0.71 0.99 -0.47 yfl055w -1.25 0.85 -1.6 3.08 -6.72 3.52 2.12 -1.43 yel063c -0.04 -0.05 -0.03 0.05 -0.27 0.16 0.78 -0.11 yol020w -0.01 0.08 0.51 -0.52 0.04 -0.16 -0.39 0.44 ypl274w 0.28 0.14 0.2 -0.61 1.19 -0.57 0.41 -0.44 ydr046c 0.26 0.3 1.82 -2 1.21 -0.45 0.15 -1.29 ynl268w -0.12 0.13 0.17 -0.3 0.88 -0.86 0.55 -0.41 ykr039w -0.64 0.5 -1.65 1.78 -1.68 1.46 0.65 0.97 ypl265w 0.07 -0.27 -0.98 1.3 1.84 0.62 -3.41 -0.14 yll061w 0.5 -0.34 0.9 -0.82 0.22 -0.07 -2.13 0.98 ybr069c 0.31 -0.49 1.21 -2 2.79 -0.65 0.35 -0.7 ydr508c 0.53 -0.38 1.68 -2.03 1.87 0.04 -1.33 0.22 ybr132c -0.43 0.09 -0.93 1.5 -1.15 1.05 0.31 0.34 ; END; BEGIN TREES; TRANSLATE 1 YBR068C, 2 YDR046C, 3 YCL025C, 4 YDR508C, 5 YBR069C, 6 YGR191W, 7 YKR039W, 8 YPL274W, 9 YLL061W, 10 YOL020W, 11 YOR348C, 12 YPL265W, 13 YNL270C, 14 YEL063C, 15 YNL268W, 16 YFL055W, 17 YBR132C ; UTREE * PHYLIP_1= (17:1.219425,(16:1.142514,(((5:0.527887,((1:0.258478,2:0.258478):0.231934,(3:0.288882,4:0.288882):0.201530):0.037475):0.245121,(10:0.721929,((6:0.516868,7:0.516868):0.150843,(8:0.242263,9:0.242263):0.425448):0.054218):0.051079):0.261486,((11:0.752391,12:0.752391):0.151729,(15:0.378119,(13:0.318941,14:0.318941):0.059177):0.526001):0.130374):0.108020):0.076910); ENDBLOCK;