AS - GM  RAPD DNA polymorphisms  - Alphabetical list

 

Click here for the key to the list of RAPD loci and abbreviations used.

 

 

======

=======

==

=========

=======

=====

=============

============

Locus

Primers

Mg

Size (Kb)

Same 

Other

Linkage    

Coassortment

name

     

mM

       

 as? 

notes

group (MIC) 

group (MAC)

======

=======

==

=========

=======

=====

=============

============

1AS02 

A12 C05

 

1.0     

     

   

lg1L-mat    

     MiLtd 

1AS02R

A12 C05

 

1.4     

     

   

lg5X-JB04   

Cag5X-RK04a 

1AT01 

B20 C01

 

0.9     

     

psMiL

lg1R-GAL1   

cag1R-AT01 (+) 

1AT01R

B20 C01

 

0.6     

     

   

lg1R-GAL1   

cag1R-ATO1R 

1AT03/R

B20 C05

 

0.55/0.42

     

   

lg1L-mat    

cag1L-AT03  

1AT04 

B07 C04

 

0.5     

     

   

lg2R-MPR1   

cag2R-AT04  

1AT04R

B07 C04

 

0.55    

     

   

lg4R-LC01   

cag4R-AT04R (+)

1AT06 

B19 C08

 

1.5     

     

   

lg5X-JB04   

     MiLtd 

1AT11 

B07 C17

 

1.2     

     

   

lg4L-BR19   

cag4L-LK04  

1AT17 

B05 C19

 

0.4     

     

   

lg4R-LC01   

cag4R-AT17  

1AT18 

B08 C02

 

0.75    

     

   

lg4L-QD02R  

cag4L-AT18  

1BB01 

E10 E12

 

1.8     

1YD20 

   

lg4L-AS01   

cag4L-YD20  

1BB01R

E10 E12

 

1.05    

1YD20R

   

lg1L-mat    

     MiLtd 

1BD03 

F01 F08

 

1.1     

     

   

lg1R-BD03   (UL)

cag1R-BD03  

1BD06 

F01 F20

 

0.4     

     

   

lg1L-mat    

cag1L-BD06 (-)

1BD08R

F02 F11

 

0.4     

     

   

lg1L-mat    

     MiLtd 

1BD10 

F03 F12

 

1.2     

     

   

lg4R-LC01   

cag4R-LC26  

1BD11 

F03 F16

 

0.33    

     

   

lg1L-mat    

cag1L-XS36  

1BD13 

F04 F11

 

0.8     

     

   

lg3R-JO06   

cag3R-LC21R 

1BD16 

F06 F18

 

1.0     

     

   

 4R-BD16  (UL)

     MiLtd 

1BD22 

F09 F11

 

0.32    

     

   

lg3L-XS43   

cag3L-BD22  

1BD22R

F09 F11

 

1.2     

     

   

 XX-BD22R (UL)

     ND    

1BD23R

F11 F17

 

1.0     

     

   

lg5X-JB04   

     MiLtd 

1BD25 

F12 F12

 

0.5     

     

   

lg5X-JB04   

     MiLtd 

1BD27 

F03 F13

 

0.2     

     

   

lg5X-JB04   

cag5X-LC16  

1BD28R

F01 F11

 

0.3     

     

   

lg3R-JO06   

cag3R-LC21R 

1BD34 

F09 F16

 

0.75    

     

   

lg5X-JB04   

cag5X-RK04a 

1BD34R

F09 F16

 

0.7     

     

   

lg5X-LC16a  

cag5X-BD34R 

1BR01 

C11 C16

 

0.5     

     

   

 4R-XS16   (UM)

cag4R-XS16  

1BR02/R

C12 C12

 

0.95/1.05

1BR02/R

   

lg5X-JB04   

cag5X-BR02  

1BR03 

C01 C05

 

1.5     

     

   

lg5X-JB04   

cag5X-BR02  

1BR04  

C05 C06

5

0.65    

     

   

lg1L-mat    

     MiLtd 

1BR05 

C03 C08

 

1.5     

1BR05 

   

lg5X-JB04   

     MiLtd 

1BR07/R

C05 C12

 

0.95/1.05

1BR02/R

   

lg5X-JB04   

cag5X-BR02  

1BR07b

C05 C12

 

0.16    

     

   

lg2R-JO66   

cag2R-XS27  

1BR08 

C08 C17

 

1.6     

1BR05 

   

lg5X-JB04   

     MiLtd 

1BR09 

C08 C19

 

1.1     

     

   

lg5X-JB04   

cag5X-JP08d 

1BR11 

C01 C10

 

0.35    

     

   

lg1R-GAL1   

cag1R-SP18R 

1BR13 

C03 C11

 

0.75    

     

   

lg5X-JB04   

cag5X-BR13  

1BR14 

C11 C18

 

0.4     

     

   

lg5X-JB04   

cag5X-JP12  

1BR15 

C11 C19

 

0.75    

     

   

lg1R-CHX1   

     MiLtd 

1BR19/R

C06 C20

 

1.62/1.59

     

   

lg4L-BR19   

cag4L-BR19  

1BR20 

C13 C20

 

1.0     

     

   

lg1R-CHX1   

cag1R-EstA  

1BR21 

C16 C16

 

0.6     

     

   

lg4L-QD02   

cag4L-QD02  

1CH01 

A06 B12

 

1.3     

     

   

lg1L-mat    

cag1L-CH01  

1CH02 

A16 B15

 

0.7     

     

   

lg2R-MPR1   

     MiLtd 

1EM01aR

D01 E19

 

0.75    

     

   

lg4L-BR19   

cag4L-BR19  

1EM01R

D01 E19

 

0.4     

     

   

lg1R-GAL1   

     ND    

1EM02 

D03 E19

 

0.9     

1EM02 

   

lg5X-JB04   

cag5X-JP12  

1EM02a

D03 E19

 

0.35    

     

   

lg5X-JB04   

cag5X-JP12  

1EM03 

D02 E16

 

0.47    

     

   

lg1R-CHX1   

     MiLtd 

1EM04 

D02 E17

 

0.5     

     

   

lg1L-mat    

cag1L-XS24  

1EM06 

D09 E10

 

0.65    

     

   

lg1R-CHX1   

cag1R-ML03  

1EM08 

D08 E19

 

0.45     

     

   

lg3R-LC08   

cag3R-JB21  

1EM08R

D08 E19

 

0.5     

     

   

 XX-EM08R (UL)

     ND    

1EM09R

D01 E18

 

0.9     

     

   

lg1R-GAL1   

cag1R-MJ16R 

1EM10 

D06 E11

 

2.0     

     

   

lg1L-mat    

cag1L-rDNA (-)

1EM11R

D06 E12

 

1.0     

1YD20R

   

lg1L-mat    

     ND    

1EM12 

D11 E13

 

0.95    

1SN21 

   

lg4L-BR19   

     MiLtd 

1EM16R

D03 E04

 

0.45    

     

   

lg3R-JO06   

cag3R-JB16  

1EM17 

D08 E08

 

0.5     

     

   

lg5X-JB04   

     MiLtd 

1EM17aR

D08 E08

 

1.6     

1KP04R

   

lg3R-KP04R  

     MiLtd 

1EM19 

D14 E11

 

1.2     

     

   

lg1R-GAL1   

cag1R-MJ16R 

1EM20 

D17 E12

 

2.0     

1YD20 

   

lg4L-AS01   

cag4L-YD20  

1EM20R

D17 E12

 

1.1     

1YD20R

   

lg1L-mat    

     ND    

1EM23 

D19 E12

 

2.0     

1YD20 

   

lg4L-AS01   

     ND    

1EM23R

D19 E12

 

1.0     

1YD20R

   

lg1L-mat    

     ND    

1EO01 

A05 A06

 

1.3     

     

   

lg1L-mat    

     MiLtd 

1EO03R

A19 B04

 

0.4     

     

   

lg1L-mat    

cag1L-PM08  

1GM02 

E13 F12

 

0.51    

     

   

lg5X-JB04   

     MiLtd 

1GM03 

E11 F08

 

1.61    

     

   

lg3R-LC08   

cag3R-JB21  

1GM04 

E18 F20

 

0.95    

     

   

 4R-XS16  (UL)

cag4R-XS16  

1GM07 

E12 F15

 

0.49    

     

   

lg5X-JP02   

     MiLtd 

1GM07a

E12 F15

 

1.85    

1YD20 

   

lg4L-AS01   

cag4L-YD20  

1GM08 

E17 F03

 

1.4     

     

   

lg5X-LC16a  

cag5X-JO68  

1GM09 

E18 F02

 

0.8     

     

   

lg1L-mat    

cag1L-JO13R 

1GM09R

E18 F02

 

0.35    

     

   

lg5X-JB04   

cag5X-LR01R 

 

 

 

Go To:

Loci:

AS-GM RAPDs

JB - JO RAPDs

JP - LS RAPDs

MJ - YD RAPDs

Cbs polymorphisms

Genes

Other pages:

Key to RAPD list

Map location summary

MIC/MAC Illustr. Guide

Genomic Maps

Home Page